La conférence comprend des délégations des commissions compétentes des parlements nationaux des États membres de l'UE et du Parlement européen. Ils sont généralement membres des commissions du budget, des affaires économiques et sociales et des affaires européennes. Les parlements décident eux-mêmes de la composition et de la taille de leurs délégations. En outre, chaque parlement national d'un pays candidat peut être représenté par deux observateurs. Les présidents du Conseil européen, de l'Eurogroupe et les membres de la Commission sont invités aux réunions de la conférence pour présenter les priorités et les stratégies de l'UE.

La conférence fonctionne sur la base du consensus. Conformément au règlement intérieur, le parlement de la présidence, seul ou, au cours du premier semestre, conjointement avec le PE, peut présenter des conclusions non contraignantes sur les résultats de la réunion. À ce jour, aucune présidence n'a présenté de telles conclusions.