W skład konferencji wchodzą delegacje właściwych komisji parlamentów narodowych państw członkowskich UE i Parlamentu Europejskiego. Zazwyczaj są to członkowie komisji ds. budżetowych, gospodarczych, społecznych i europejskich. Parlamenty same decydują o składzie i liczebności swoich delegacji. Ponadto każdy parlament narodowy państwa kandydującego do członkostwa może być reprezentowany przez dwóch obserwatorów. Na spotkania konferencji zaprasza się przewodniczących Rady Europejskiej, Eurogrupy oraz członków Komisji, którzy przedstawiają priorytety i strategie UE.

Konferencja działa w oparciu o zasadę konsensusu. Zgodnie z regulaminem, parlament prezydencji, samodzielnie lub wspólnie z PE, może przedstawić niewiążące konkluzje w sprawie wyniku spotkania. Dotychczas żadna prezydencja nie przedstawiła takich konkluzji.